İlçe Sağlık Müdürlüğü Sivil Savunma Birimi, olası afet ve acil durumlarda sağlık hizmetlerinin aksamadan devam etmesini sağlamak için önceden hazırlık yapar. Birim, afetlere karşı sağlık personelinin eğitilmesini, gerekli malzeme ve ekipmanların temin edilmesini, afet anında sağlık hizmetlerinin koordinasyonunu yapmayı hedefler. Ayrıca, sağlık kuruluşlarında afetlere yönelik altyapı düzenlemelerini ve tatbikatları gerçekleştirerek, tüm birimlerin afetlere karşı hazırlıklı olmasını sağlar.
Birim, aynı zamanda afet sonrası sağlık hizmetlerinin etkin bir şekilde yürütülmesi için kriz yönetimi planları hazırlar ve uygular. Ayrıca, afet bölgesine yönelik ilk yardım hizmetlerinin verilmesi, sağlık ekiplerinin yönlendirilmesi ve sağlık merkezlerinin işlevselliğinin sağlanması gibi görevleri üstlenir. Bu süreçlerde, ilçe sağlık müdürlüğü ile diğer kamu ve sivil toplum kuruluşlarıyla koordinasyon sağlayarak, afet ve acil durumlara hızlı ve etkili bir şekilde müdahale edilmesini amaçlar